La formation du gaz naturel fossile peut résulter de deux processus distincts :
La décomposition anaérobie de matière organique permet d'obtenir du méthane de façon renouvelable : on parle alors de méthanisation et de biogaz. Le méthane est ainsi le seul hydrocarbure classique qui peut être obtenu grâce à un processus biologique naturel.
On peut aussi rattacher au gaz naturel le méthane présent dans les strates de charbon. Au début du XXIe siècle, sa récupération est une activité émergente, notamment aux États-Unis et depuis peu au Canada. Ces pays font face à un début de pénurie de gaz naturel et ont d'importantes réserves de charbon.
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